Pierwsza świątynia powstała tutaj w XIII w. Murowano-drewniana konstrukcja uległa jednak degradacji. Na początku XV w. na jej miejscu wybudowano nowy kościół, a fragmenty jego murów zachowały się do dziś w prezbiterium. Patronem świątyni został św. Mikołaj, biskup z Miry. W okresie od 1540 r. do początku XVII w. budynek pozostawał w rękach ewangelików. Obiekt był wielokrotnie niszczony podczas pożarów miasta. Ostatniej przebudowy dokonano w 2. połowie XIX w., choć zachowano późnogotyckie elementy. Większość obecnego wyposażenia wnętrza pochodzi również z tego okresu. W kościele znajduje się obraz Matki Boskiej Klewańskiej. Opiekę duszpasterską sprawuje Zgromadzenie Księży Misjonarzy św. Wincentego à Paulo.