Przez Wardyń prowadziła linia kolejowa nr 410 łącząca Kostrzyn nad Odrą ze stacją Grzmiąca, łącznej długości 240,452 km. Obecnie w większości jest rozebrana lub zamknięta (podobnie jak stacja Wardyń). Zachował się jednak zabytkowy zespół budynków stacji Wardyń w odległości 1 km od wioski o tej samej nazwie.