Przez Wardyń prowadziła linia kolejowa nr 410, łącząca Kostrzyn nad Odrą ze stacją Grzmiąca, o łącznej długości 240,452 km. Linię oddano do użytku 30 sierpnia 1882 r. Obecnie w większości jest rozebrana lub zamknięta. Zachował się jednak zabytkowy zespół budynków stacji w odległości ok. 1 km od Wardynia. W pobliżu znajduje się skrzyżowanie linii kolejowej z drogą lokalną do Korytowa.